1.我們大約擁有三百兆個人類細胞和三百九十兆個微生物細胞—兩者勢均力敵。所有的結論都顯示：我們不只是我們。
2.我們的細胞裡攜帶兩萬到兩萬五千個基因，但根據估計，體內微生物的基因數是這個數字的五百倍。
3.人類IBS的患者通常伴隨擁有過多激發免疫反應的細菌，而缺乏抑制免疫系統的細菌。其他如肥胖、糖尿病、氣喘、過敏和結腸癌等狀況也有出現類似的模式。它們不是單一微生物造成的，而是整個群落一起落入不健康的狀態。它們是共生出現問題的案例。
4.隨著定義個體的方法逐漸失效，你可以把希望放在免疫系統上，因為它應該可以區分我們自己的細胞和入侵者的細胞。但這也不太對。
5.在無菌培養箱中的小鼠，牠們不僅壽命較短、生長較慢，還發育出異常的腸道和免疫系統，而且容易受到壓力和感染的影響。
6.短尾烏賊的經驗告訴我們，發育並非如此，除了需要動物基因中的指令之外，也需要來自微生物基因的指令。斑馬魚和小鼠如果在無菌的情況下長大，牠們的腸道便無法完整發育，指狀皺折會變短，腸壁會有空隙。
7.吸引華美盤管蟲的是細菌，更準確地說是生物膜（biofilm），這種由細菌鋪排而成的薄膜會在水下物體的表面快速生成。
8.（至少在小鼠體內）多醣A可以預防和治療結腸炎和多發硬化症等發炎疾病。這些都是免疫系統過度反應造成的疾病，而多醣A能幫助平復反應，恢復健康。多醣A是來自細菌的分子。
9.瑪茲曼尼恩證實了腸道微生物會影響免疫系統，怕特森則發現這個免疫系統會影響發育中的大腦。
10.細菌存在於「壞的」寄生菌和「好的」互利共生菌所構成的連續光譜之間，而且在不同位置則可能在不同光譜上，例如幽門螺旋桿菌會引起潰瘍和胃癌，但也可以預防食道癌，而且造成利弊的是同一個菌株。
11.每段共生關係都在某種程度上隱藏著敵意，唯有適當的控管，且往往還需要精心的調整，才能維持互利的狀態。
12.噬菌體喜歡黏液。在一般的環境中，細菌和噬菌體的數量大約是1：10，但在黏液中卻是1：40。
13.噬菌體（是病毒）—與動物（包括我們）有著互利互惠的關係。噬菌體幫助我們控制微生物，而我們提供充滿細菌的世界讓它們繁殖作為回報。羅爾博士推測噬菌體是最早的免疫系統，它讓最簡單的動物可以控制微生物。
14.免疫系統的主要功能是管理我們與常駐微生物間的關係。這個系統的重點在於維持平衡和妥善管理，而不是防禦或破壞。
15.腸道微生物也解釋了胃繞道手術成功的部分原因。手術之後，重組了腸道微生物群落，增加了很多菌種，包含嗜黏液艾克曼菌。
16.衛生假說及各種衍生理論的精髓：暴露在比較廣泛的微生物中，可以改變體內的微生物組成，並抑制過敏性發炎的症狀。
17.如果嬰兒是剖腹產，他們最先接觸到的微生物便是來自母親的皮膚和醫院環境，而不是媽媽的產道。目前尚不清楚這樣的差異長遠會有什麼差別，但或許解釋了剖腹產嬰兒在往後的人生更容易罹患過敏、氣喘、乳糜瀉和肥胖。
18.當細菌分解纖維時，會產生短鏈脂肪酸，這些脂肪酸能吸引抗發炎細胞進駐，讓免疫系統恢復平靜。如果沒有纖維，會讓我們容易罹患發炎性疾病。
19.多形擬桿菌和其他微生物可以在分解植物的醣類後，釋放可直接滋養我們細胞的物質。它們總共為人類提供了百分之十的能量，而牛羊則高達百分之七十。
20.農民每隔數年交替種植玉米和黃豆，成蟲在玉米田中產下的卵便會在黃豆田中孵化成幼蟲，然後死亡。這種作法稱為輪作。
21.抗蛙壺菌：藍黑紫色桿菌在實驗室條件下，能保護青蛙免受侵害。
22.目前仍沒有明確證據顯示益生菌能幫助過敏、氣喘、肥胖、糖尿病、自閉症，或其他微生物群或有關而導致不適症狀的人，而且也無法確認有這些好處是否是因微生物群落改變所造成的。
23.不存在所謂「好的」微生物，即使長久以來就屬於人類微生物群落的成員，都能同時扮演正反兩派的角色。在許多研究，嗜黏液艾克曼菌是大腸癌個案中的常客。
心得
20210326
本書應該是比爾蓋茲推薦書，講述動物體內的微生物（細菌、病毒）共生的事。自從人類發現微生物能致病來，幾乎所有微生物都被視為不好的，課堂上所教的也是哪種會產生哪些疾病，少介紹哪種能帶來好處。動物的天性就是會對於威脅比較重視，人類也是，會去避免對自己不利的環境事物。至於對自己有利的微生物，那幹嘛去瞭解，反正生命不會受到威脅，而且它就在那裡了。
目前本書愈讀愈有趣。以前會好奇為何海上插根竹竿，就會長出牡蠣？原來跟船底的華美管蟲類似道理，是由於biofilm來的。難怪有的地方好插蚵，有的地方不好，還有華美管蟲能當作水質污染指標。優氧化時細菌變多，華美管蟲就多。牡蠣幼蟲沒有適當的biofilm附著時，無法進行發育與變態，以幼蟲形式漂阿漂。
本書也拓展我對微生物的看法。腸道細菌影響免疫系統，免疫系統影響中樞神經，所以說細菌會影響神經系統、思考想法，這是必然的。想到《尋找無限的盡頭》，強迫症女主角誤解了這點。我們並沒有什麼純粹的自我，此時此刻的「自我想法」，都是由複合的因素合成的。主軸理念、週遭環境、身體生化反應情形、體內的蛋白質振動與體內共生的微生物，共同組成的自我。如果瞭解這點或許她的強迫症會好一點吧！
疾病中IBS、自閉症可能與腸道群落有關，其中自閉症對我是新的觀點，說不定真的有可能喔。不過不少是高功能自閉症，可能是某方面的天才，如果說他是群落異常造成的，是否天才的那部分也跟群落異常有關？如果給予群落調整，那他的天才會消失嗎？這樣是好是壞呢。在另一本書中看到出生的嬰兒到成人，大腦成長到4倍，大部分的人的神經認知、觀念是後天影響大於先天。所以共黨人真的可能視為是一亞種，因為在發育中大腦接到的刺激與造成的發育就不同了。那麼地域是否也有影響？不同地區菌種不同，在大腦發育時會有不同的刺激，可能也是造成不同地方人一些觀念想法不同的原因，有別於後天人文環境的原因？
20210330
不少觀念蠻有趣的，而且對我新穎。剖腹產嬰兒無法接受母體產道的菌落，可能造成易過敏的體質；噬菌體喜歡在黏液（如腸、呼吸道）；纖維的功用是被細菌分解後產生短鏈脂肪酸，藉以穩定免疫系統；輪作使害蟲無法持續危害。種種都增加不少知識。
母乳與微生物一起混和給早產兒使用，有助於改善壞死性腸炎及腹瀉。其實腸道內有許多共生微生物，以攝取進不同的微生物群落，與之競爭，改變成我們要的群落或功能，這樣的想法應該是正確的。只是實際很難做到。攝取進去的微生物儘管億、十億之數，與腸道內菌可能只有千分之一而已，光數量上就難以競爭。再來需要以食物餵養它，並且需要持續攝入。如果一次吃10包益生菌如何？提升到百分之一。我的優酪乳夢破碎..哈哈。不過喝個應該還是不錯的。
糞便移植療法古老，但現在又重出江湖。這療法令人耳目一新，治療困難梭狀桿菌或有奇效，我以前有聽聞過嗎？
不過書中將免疫系統描寫的有點簡單，就是人體與微生物的平衡調整者。一些地方感覺有點暗示免疫系統都是不好的。實際上免疫系統遠複雜於此，與細胞的功能調節、組織凋亡清除、甚至得癌症都有關係。總而言之本書相當有趣，帶來不少新知，看過相當好。
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