2.無恆變形蟲的DNA含量是人類的200倍，可是他的基因數目遠少於人類。這種古怪的矛盾被稱為C值悖論。
3.大部分真核細胞的小房間，都是由最簡單的囊泡變化而來的，有些被拉長壓扁，有些被塑成管狀。最不尋常是核膜，它看起來像是兩層連續的、包住細胞核的膜，實際上是一系列大而扁的囊泡相接而成。
4.粒線體和葉綠體的雙層膜特徵，連同它們自己的DNA，自己的核醣體、自己的蛋白質組裝以及半自主的分裂，一同指證了它們的細菌起源。
5.卡瓦略史密斯主張，推動真核生物演化的關鍵步驟，是細胞壁消失這件大災難。
6.普朗克：「一個科學新概念獲得勝利靠的不是說服對手，而是因為最後對手終將死絕。」
7.對細胞來說，維持充足的質子動力，要比保留ATP進行其他關鍵的工作（例如生殖）來得更重要。
8.在生長緩慢，且多功能性備受重視的時候，細菌就可以容忍比較大的基因體。即使如此，在所有全方位細菌中，天擇仍會讓基因體較小的種類脫穎而出，這似乎替細菌基因體的大小設定了一個最高限額，大約是一千萬個字母。
9.細菌可以在數小時到數天內丟掉冗餘的基因，不管長遠來看這個行為有多麼愚蠢。以這個實驗為例，如果負責抗生素耐受性的基因不被需要，他便會從族群中大部分細胞的身上消失，即使未來可能有需要的一天也是如此。
10.已知細菌的基因體尺寸上限大約是九百萬到一千萬個字母，編寫約九千個基因。任何細菌獲得的基因超過這個數目，都會傾向於再度失去它們，因為複製額外的基因會拖慢複製的速度，它們又無法提供與之相稱的好處。這一點上細菌和真核生物完全相反。
11.真核生物的細胞體積平均是細菌的一萬到十萬倍，不過它們的呼吸效率並沒有隨著體積的增加而像細菌那樣下滑。要增加能量效率，真核生物只需要增加細胞內粒線體膜的表面積；亦即只要多擁有一些粒線體就夠了。
12.大尺寸細菌的能量劣勢，往往競爭不過小型的細菌。我們在細菌身上看不到真核式的掠食行為。真核能擺脫這種困境，似乎是因為它們的產能工作在體內進行，這使它們相對不受體表面積所束縛。
13.柯普定律是演化生物學中的一個假說，認為自然界中大體型生物是源自積極的選擇，而不是隨機過程。
14.小鼠活兩到三年，而大象六十年，不過兩者一輩子的總心跳次數很接近。而且在一生當中，兩者體內的單一細胞所消耗的氧氣和食物總量大約相等。一個細胞可以燃燒的能量似乎是固定的。
15.碎形（拉丁語fractus）是在任何尺度下看起來都相似的幾何圖形。
16.克雷伯曲線(代謝率增加的指數比上體重增加的指數)通用常數0.75已證實是錯的，各物種不同，爬蟲類的斜率比較高0.88，有袋類0.6。
17.最大代謝率的修正斜率是0.88，這樣的差距比我們在靜止代謝率所看到的要小，這表示有氧範圍會隨著體型增長：動物愈大，靜止和最大代謝率的差距就愈大；換言之，大型動物普遍會有更長的續航力和更大的力量。
18.防止氧氣的毒性，因為它們會形成自由基，最好的方法就是保持組織內的氧氣濃度盡可能地低。動物界各種生物，組織內的含氧量都很接近，大概是大氣中氧濃度的百分之三到四。
19.而要調節組織的需氧量，可利用微血管的密度，或是微血管的開關。
20.鳥類和哺乳類的恆溫不是來自肌肉，而是來自臟器。
21.在野外，哺乳動物生存所消耗的能量，平均而言是同樣大小爬蟲類的三十倍。20度時，爬蟲類所需要的能量只有哺乳類的百分之二到三。
22.休息中的哺乳類，它們的質子梯度約有四分之一以熱的形式散逸掉。
23.恆溫的特性很可能是在體型夠大，熱量的生成足以抵銷熱量流失的動物身上演化而來的，而它們的小體型後代，則必須靠進一步的調整才能解決保溫的問題。如老鼠身上的棕色脂肪。
24.基因似乎完全沒有編寫細胞的構造：基因能產生蛋白質，但卻沒有研究發現如何來產生這裡的膜或是膜去哪裡。意即只有細胞能產生細胞。
粒線體造成Apoptosis
25.Apoptosis希臘文，最早由希波克拉底使用，意思是骨頭的衰微。第二個p不發音，讀成「ape-oh-toe-sis」
26.apoptosis。細胞先是縮小，並在表面產生泡泡。最後細胞裂開成為小小的，由膜包裹的構造，名為凋亡小體，免疫細胞會將它們吸收掉。
27.負責執行細胞死亡計畫的劊子手，是名為半胱胺蛋白酶的蛋白質，人類身上有11種。它的作用是將蛋白質切成片段，有些蛋白質會因而被活化，繼而去分解細胞內的其他成分，包含DNA
28.達謨克利斯之劍Damocles：
達摩克利斯是公元前4世紀義大利錫拉庫薩的僭主狄奧尼修斯二世的朝臣，他非常喜歡奉承狄奧尼修斯。他奉承道：狄奧尼修斯實在很幸運，能擁有這樣至高的權力和威信。狄奧尼修斯提議與他交換一天的身份，那他就可以嚐到作為首領的滋味。在晚上舉行的宴會裡，達摩克利斯非常享受成為國王的感覺。當晚餐快結束的時候，他抬頭才注意到王位上方僅用一根馬鬃懸掛著的利劍。因為狄奧尼修斯在他的統治下樹敵許多，他以此劍表示，即使擁有如此多的權勢財富，也得處處提防想幹掉他的人。達摩克利斯立即失去了對美食和美女的興趣，並請求僭主放過他，他不想再擁有如此高的權位了。
達摩克利斯之劍通常被用於象徵這則傳說，代表擁有強大的力量卻也得時常害怕被奪走。
29.啟動Apoptosis方式有兩種：外部途徑，如免疫細胞產生化學信號與初期癌細胞表面受器結合引發。第二是內部途徑，如細胞受損，像照射到紫外線引起DNA損傷活化內部途徑。
30.直接損傷細胞就可以了，毒素，污染物，化療藥，病毒和細菌都會引發。物理性的逆境也會，冷熱、發炎、氧化。
31.觸發apoptosis的主要因素，是粒線體的內膜膜電位，也就是呼吸作用產生的質子梯度消失。如果內膜經過了一段時間的去極化，那麼細胞一定會繼續走向細胞凋亡。
32.2步驟：膜的去極化跟釋放自由基。
33.細胞色素c一旦從粒線體釋放出來，游離在細胞內，它們就會和其他一些分子形成凋亡小體，最終活化半胱胺酸蛋白酶。
34.過量自由基生成，會使粒線體外膜開洞稱為粒線體通透性轉換孔，使得外膜膨脹破裂，並伴隨蛋白質的釋放。
35.考古學重建，暗示在最初的真核生物上，粒線體和宿主細胞的關係是寄生的。可以推測原始粒線體會進入一隻古細菌體內，對他的健康監控一段時間，然後觸發細胞的死亡，將宿主打包好再移動到下一個宿主身上。
這段關係最後將死亡的裝置留給了真核細胞。
性
36.團藻，自由基生成量增為兩倍便會活化和性有關的基因，產生配子。因此布萊克史東的理論：細胞凋亡的最初幾個步驟曾經可能引發了性，而非死亡。
37.性和死亡是彼此交織的。在DNA受損時，透過基因重組，或許可以靠同個基因的健全拷貝來取代他；在細胞受損時，將他從身體移除，讓同基因的健全拷貝（健全的細胞）來取代它
38.1985年西班牙帕蒂諾奧運金牌，被測出染色體XY，但她具有「雄性激素抗性」無法對睪固酮做出反應，因此便發育為預設性別女性。
39.有些男人擁有兩個X染色體但卻沒有Y染色體。這種情況下通常是其中一個X染色體併入了一段Y染色體。但這並非絕對，在完全沒有Y染色體基因下發育成男性也是有可能的，或是XXY（柯林菲特氏症候群）。
所以XX，XY並非絕對！
40.鳥類的性染色體寫成W和Z。雄性攜帶2個Z，雌性攜帶WZ。一些甲殼動物，性別並非固定，個體可能經歷性別轉換。
41.普遍的趨勢：合子（受精卵）是不能容忍雙親兩方都傳下胞器（正確說，是細胞質），只能有單親的細胞質能傳下去。問題似乎是出在細胞質基因體：如粒線體、病毒、共生菌。
42.在雌雄同體開花植物中，粒線體盡一切力量避免自己被囚禁在植物的雄性部位，因為花粉不會將它們遺傳下去。它們常使雄性器官不孕，方式是打斷花粉的發育。藉由使雄性器官不發育，粒線體將雌雄同體變成純雌性，以確保自身的傳播（族群變成雌雄同體+雌性）
43.粒線體藉由傷害雄性或殺死雄性確保自身能傳播，像Leber's hereditary optic neuropathy也是。
44.在小鼠和人類身上，雄性粒線體在卵中會被泛素（蛋白質）標記，讓它們在數天之內被摧毀。
45.例外：異質體（受精卵有雄性細胞質）。蝙蝠。可能會針對適應力最強的粒線體進行篩選。
46.至少有百分之十，或百分之二十的人是異質性的。
能量與熱
47.我們體內的熱是粒線體虛擲膜上的質子電位而產生的。我們面臨到的狀況是二選一，被浪費在產熱上的質子梯度，就不能用來製造ATP。
48.非洲人：因不需產太多熱，所以會傾向產ATP，而會產生較多自由基，於是更易受到相關疾病的侵擾如糖尿病、心血管。因紐特人傾向產熱，ATP較少，果然這些疾病也較少。但其男性精子的粒線體ATP較弱，所以易有精子不孕症。
雙性別
49.為何會有雙性別，是因為雙基因體系統需要粒線體和細胞核基因的密切配合。為了確保每一代的配對盡可能完美，讓一組粒線體基因和一組細胞核基因配合測試是必要的，這說明了為什麼粒線體基因必須只能來自親代中的一方。
老化
50.長壽的哺乳類和鳥類，都會降低呼吸鏈自由基滲漏的比例。
51.蛋白質、醣類還有脂質的受傷是可以修復的，除非受傷速率壓倒性的快（如輻射中毒）。DNA則不同，雖然DNA受傷也可以修復，但是某些損傷會打亂原本的序列，因而產生突變。
52.所有的粒線體疾病都是異質性的，也就是患者同時有正常和不正常的粒線體。
有些粒線體疾病的遺傳會符合孟德爾定律，因為造成這些疾病的是表現粒線體蛋白質的細胞核基因。
53.遲早有天會有些細胞耗盡了正常的粒線體。這時如果它再次收到徵召，必須生成更多的粒線體，細胞沒有選擇，只好複製那些不健全的粒線體，最後細胞被細胞凋亡給移除-組織會逐漸地喪失功能，隨之而來的便是老化和死亡。
54.馬德里的巴爾哈研究發現，滲漏的自由基大多從呼吸鏈的複合體I漏出來的。這個位置的滲漏會直接流到粒線體的基質，也就是緊鄰粒線體DNA的位置。
55.鳥類降低自由基滲漏率的另一個可能方法，是使它們的呼吸鏈解偶聯，指的是解開電子流和ATP生成之間的連結，所以電子便會以熱的形式消耗掉（另一方法是細胞有大批粒線體且每個粒線體中有大量的呼吸鏈，使每條產線降低工作量，即比哺乳類更有生產餘力）
56.卡路里限制：使還原態複合體降低，這解釋了為何運動員耗氧量大，卻不會老的比較快。但是長壽的代價通常反映在繁殖力的縮減上。
讀書心得：
20200223
本書也是由尼克．連恩教授所著。因為看了他的生命的躍升後，覺得作者著作內容重要且精闢，想把他所能找到的著作都閱讀一次故借閱。但此書閱讀起來總有不順之處，有些語意奇異或斷句奇怪之處，不向之前閱讀的生命的躍升，內容那麼平順。譯者當時為博士生，或許有關。躍升則為專業譯者。
大概200頁開外開始感覺內文流暢，譯者的翻譯功力進步感受的出來
本書到目前比較多基礎生化，重點環繞在粒線體上。我們能生為智人，擁有燦爛的一生，然後無可避免的死去，都是粒線體之功。成也粒線體，死也粒線體，唉（？）
最近發生Kobe Bryant 逝世事件，他曾說一句名言：You cant have life without death.
不知道他講這句話的背景跟動機是什麼，不然只是聽起來很漂亮而已，有多少人真心想過，如果是真的，why：why? why cant I have life without death?
這句漂亮話其實並不正確
第265 266頁有提到我一直存有的疑問：對個體而言，死亡跟性到底有何意義，舉例性，似乎無意義，以致於必須靠激烈的性快感來賄賂我們。
20200227
對於天擇，看到目前，我仍是認為天擇的作用應該在個體上，而非群體上。群體是個體經過天擇後複製的結果。看來傾向複製自己的種族才能贏得最後的勝利。但是apoptosis的存在，難道多細胞後真的天擇也是作用在群體上嗎？
愈來愈認識生物學與量子力學，無法解除我深層的憂愁與煩惱，對於自己注定的命運（誕生與死亡）究竟應該感到幸運，或是無力呢？
想到塔木德裡一群拉比辯論，最後結論是還沒出生的人最幸福。
目前所有有after life學說的宗教皆無法說服我，因我認為我已知真相了。我沒有堅定的靈魂信仰，甚至說我根本就不相信。
那些學說是不堪一擊的，他們自己就定義不好什麼是靈魂了。
但是這樣的相信（我所認為的真相），究竟算不算是可悲的呢？還是像宗教人士或一般世人一樣，相信有一個根本自己也不知道在講什麼的未來（來生，或是靈魂永存）
比較好嗎？
還是說連思考這兩者的差異，根本也是無意義的呢？
儘管如此，在此之前我仍選擇繼續閱讀，瞭解更多更多。或許以後我唸到人文學了，看法能有所不同，希望更豁達！
比想像更多行為、生物模式都是粒線體所控制，生、老、（某些、癌症）病、死都是，人類個體真是粒線體的囚犯，我是無法改變或對抗的了，能做的只有在有限的時間內改變我的行為。
20200304
打字打到一半有些疑問，組織內逐漸喪失功能，那總還是有健全的細胞吧，為何不能發出信號叫那些健全的細胞分裂就好？
長壽的代價通常反映在繁殖力的縮減上：和我在生命的躍升那本的看法竟不謀而合，雖然句子不太一樣。那時我想到，可能終極的個體就是不會死亡但不會生殖/或是個體自生殖，或許真的有這種存在過，但是他的身體能力可能不突出，而且族群沒有留下來
總結這本書也帶給我許多知識，與生命的躍升一樣知道現象後面的原理。擷取56條重點不知是否過多，期初階段先這樣未來知識更豐富了再逐漸精要化。在個人實作上的收穫是限制卡路里以及或許多攝取CoQ（或許再+omega3）
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